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质谱检测的关键 | 蛋白内切酶

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01

蛋白质谱检测
 

蛋白质是生物体中至关重要的分子,其结构和功能对于生命活动具有重要影响。蛋白质谱检测作为一种先进的分析技术,为我们提供了深入了解蛋白质的工具。它不仅可以帮助我们鉴定和定量蛋白质样品,还可以揭示蛋白质的结构、修饰和相互作用等信息,常见的质谱仪器主要有质谱质量分析仪(MS)和液相色谱(LC)等仪器,用于离子化、分离和检测蛋白质样品。

 

蛋白质质谱鉴定方法通常使用串联质谱(MS/MS)和液相色谱-质谱联用(LC-MS/MS)等方法,其中,简单蛋白样本用MS/MS,混合复杂蛋白样本用LC-MS/MS。两种方法作用原理相似:先将蛋白质利用蛋白酶消化成肽段,肽段在质谱仪中会离子化带上一定量的电荷,离子检测器可以鉴定各肽段的质荷比,从而获知各肽段的相对分子质量;质谱仪会继续打断某些肽段再次分析,生成二级质谱,从而获得肽段的序列信息;通过质谱数据库比对分析,即可鉴定蛋白质。

 

 

蛋白质谱检测主要有一下几种应用,生物制品开发:蛋白质谱检测在生物制品的研发过程中起着重要作用,可以帮助鉴定和验证蛋白质产品的纯度、结构和功能;生物标志物鉴定:通过蛋白质谱检测,可以发现与特定疾病相关的生物标志物,为早期诊断和治疗提供依据;药物代谢研究:蛋白质谱检测可用于研究药物在体内的代谢过程,揭示药物的药代动力学和药效学特征。

 

根据质谱检测原理,我们可以知道蛋白样本制备的过程至关重要,这决定了最终质谱结果的好与坏,而蛋白样本制备的关键就在于蛋白内切酶的选择了。

 

02
产 品 推 荐
 
  • Lysyl Endopeptidase®质谱级赖氨酰肽链内切酶

 

本产品是质谱分析前处理时常用的蛋白分解酶即赖氨酰肽链内切酶,该酶可以特异性切除赖氨酸基团C末端的多肽,可用于蛋白测序分析和Lys-X化合物的酶合成。若同时使用赖氨酰肽链内切酶和胰酶,可更好地切断赖氨酸基团的多肽,增加多肽的数量。产品已按照使用习惯做成小包装,是方便使用的冷冻干燥品。20 μg/支可用于100-200个样品的凝胶内消化。

 

 PART.01 产品信息 
 
01
来源

细菌

02
外观

冻干粉(包含2mmol/L Tris-HCl缓冲液,pH8)

03
活性

0.03~0.07 AU/vial

04
分子量

27,000(琼脂糖过滤),30,000(SDS-PAGE)

05
溶解性

溶于水或缓冲液

06
稳定性

溶解于pH值5.0-12.0的Tris缓冲液中,可在4℃稳定保存2年;在pH值6.0-11.0、30℃时能稳定保存,但温度超过50℃时不稳定。

07
最适pH值

9.0~9.5

08
等电点

6.9~7.0

09
底物特异性

可水解底物——Tos-Lys-OMe、Bz-Lys-NH2、Bz-Lys-pNA、Lys-pNA

 

不可水解底物——Bz-Arg-NH2、Bz-Arg-pNA、Arg-pNA

10
抑制剂

DFP、PMSF、TLCK

 

 
PART.02 产品特点
 
 

高特异性、高蛋白质消化率、适用于蛋白质谱分析

 

提高裂解效率、增加肽段数量

 

根据使用量特意制备小包装,方便使用

 

03
应 用 实 例
 

分别采用胰蛋白酶(Tp)、赖氨酰肽链内切酶(Lys-C)和Tp与Lys-C 联用进行胶内酶切的效果比较。

 

牛血清蛋白BSA的条带(100 ng)通过SDS-PAGE获得,然后分别用Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp进行酶切,再用MALDI-TOFMS法进行分析。这些蛋白酶的实验效果见下表,这些结果表明Lys-C酶解的漏切位点数(Missed Cleavage)最少。Tp酶解时加入Lys-C后,漏切位点数有所降低,同时,可以鉴定出更多的多肽。

 

表1:Tp、Lys-C 和 Lys-C+Tp的结果对照

 

胰蛋白酶(Tp)(图 a)和赖氨酰肽链内切酶(Lys-C)+Tp( 图 b)

酶切后的质谱结果对照图。

 

Lys-C+Tp酶切后,可以在m/z=2000时得到吸收峰,而单独的Tp酶切在m/z=2000时没有吸收峰。该结果表明 Lys-C 可以提高测序覆盖度。

相 关 产 品 
 
 

125-05061

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赖氨酰肽链内切酶,MS

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质谱级

产品

名称

                     处理体积

   规格

   级别

 

产品数据来源富士胶片和光(广州)贸易有限公司 

http://labchem.fujifilm-wako.com.cn/pdf/show/152.html

 

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